Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUX4L9Q6RFH8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms