Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP4Q6PIL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms