Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO38Q6PIJ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms