Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE2Q6PIF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE2Q6PIF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE2Q6PIF2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms