Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms