Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETSATQ6NUM9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RETSATQ6NUM9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms