Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms