Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC3HQ6NTF7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
APOBEC3HQ6NTF7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC3HQ6NTF7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms