Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRNP1Q6NT89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNP1Q6NT89 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNP1Q6NT89 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms