Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB2Q6NT52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB2Q6NT52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms