Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM68Q6AZZ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms