Protein–RNA interactions for Protein: Q6A162

KRT40, Keratin, type I cytoskeletal 40, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT40Q6A162 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT40Q6A162 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT40Q6A162 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT40Q6A162 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT40Q6A162 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT40Q6A162 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT40Q6A162 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT40Q6A162 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT40Q6A162 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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