Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMBRD2Q68DH5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD2Q68DH5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms