Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E4F1Q66K89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4F1Q66K89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms