Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEF1DP3Q658K8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1DP3Q658K8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms