Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX4Q63HM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCNX4Q63HM2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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