Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYPL2Q5VXT5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYPL2Q5VXT5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYPL2Q5VXT5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms