Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C12orf60Q5U649 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C12orf60Q5U649 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms