Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PXDC1Q5TGL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms