Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEPDC1Q5TB30 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEPDC1Q5TB30 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEPDC1Q5TB30 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms