Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CEP170Q5SW79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CEP170Q5SW79 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms