Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms