Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRPB2Q5JXA9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRPB2Q5JXA9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRPB2Q5JXA9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRPB2Q5JXA9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPB2Q5JXA9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms