Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC3H12AQ5D1E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZC3H12AQ5D1E8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12AQ5D1E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms