Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD12Q587J7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD12Q587J7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD12Q587J7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms