Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIN52Q52LA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIN52Q52LA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms