Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP19-7Q3SYF9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms