Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LSM12Q3MHD2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms