Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms