Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms