Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UVSSAQ2YD98 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UVSSAQ2YD98 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UVSSAQ2YD98 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms