Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM71Q2Q1W2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms