Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC6LQ2NKX8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERCC6LQ2NKX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms