Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC96Q2M329 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC96Q2M329 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms