Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ISXQ2M1V0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms