Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM187BQ17R55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187BQ17R55 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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