Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP6V1FQ16864 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP6V1FQ16864 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP6V1FQ16864 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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