Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK4Q16654 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK4Q16654 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDK4Q16654 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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