Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMN1Q16637 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMN1Q16637 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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