Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNMB1Q16558 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNMB1Q16558 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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