Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAPC1Q16533 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNAPC1Q16533 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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