Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDCD2Q16342 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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