Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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