Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN9AQ15858 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN9AQ15858 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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