Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ITSN1Q15811 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITSN1Q15811 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
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