Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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SEC23BQ15437 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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SEC23BQ15437 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC23BQ15437 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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