Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RABEP1Q15276 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms