Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRLQ15198 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRLQ15198 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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