Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCOLCEQ15113 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCOLCEQ15113 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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