Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
R3HDM1Q15032 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
R3HDM1Q15032 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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